Чтобы обновить систему до Сизифа, нужно указать в /etc/apt/sources.list путь к репозиторию --
раскомментировать с учётом ближайшего зеркала строчки вида
при обновлении по сети или дописать нечто типа
если репозиторий находится локально в папке /var/ftp/ALTLinux/Sisyphus,
или выполнить apt-cdrom add для добавления компакт-диска с Сизифом. Прочие строки (про Master, в том числе updates и backports) там должны быть закомментированы.
Также нужно удалить файлы из /etc/apt/sources.list.d, чтобы в обновлении не участвовали пакеты из репозитория к Master. Далее нужно выполнить команды apt-get update и apt-get dist-upgrade.