При установке Linux на систему где уже присутствует Windows, возможно утрата способности загружать Windows
fxmbr – восстановление MBR
fixboot – восстановление загрузчика
Рекомендуется проверить/скопировать с CD файлы ntldr и ntdetect.com (с дистрибутива Windows).
Для архивных целей установленный Windows можно без проблем сохранить/восстановить с помощью tar.
Не забывайте указывать codepage=866 при монтировании...