А FAT чем специфичен? Там точно так же кодировка внутри и снаружи может быть разная.
JFS — давить. Это единственное поделие IBM, к которому я не питаю никаких позитивных эмоций. Нафиг он не нужен никому. Из него только код полезный брать есть смысл :)
Насчёт fuse — в любом случае соглашусь, что подобный модуль будет полезен.