Если программа таскает с собой одну или более наличествующих в системе библиотек (например, zlib или libltdl) и пытается собираться штатно с ними, от этого следует отучать: как минимум такое плохо дублированием кода, как максимум — дополнительными проблемами с исправлением ошибок в безопасности, которые порой обнаруживаются в этом самом коде. Если он оформлен исключительно разделяемой библиотекой, то достаточно обновить её и перезапустить все процессы, происходящие из слинкованных с ней бинарников; а вот если «зашит в пузо», приходится отдельно заниматься ещё и данной конкретной программой.
В клинических случаях используются слегка или сильно модифицированные версии...
При вопросах 
поищите письма Dmitry V. Levin и Alexey Tourbin по теме.