При нормальной работе разумно держать раздел /usr в режиме «только для чтения», это помогает гораздо легче переживать сбои по питанию, глюки файловой системы, и прочие радости жизни. Однако при обновлении необходимо не забывать каждый раз перемонтировать все необходимые разделы из режима read-only в режим read-write, что неприятно, да и вообще делать лениво (более ленивы чем админы разве что только программисты...).